Dependiendo de la vacuna, se tarda de seis a 22 meses en producir un lote. Los ciclos de producción son mucho más largos que para los medicamentos químicos. Por ejemplo, se tarda de nueve a diez meses en producir la vacuna antitetánica y 11 meses para la vacuna antidiftérica.

El hecho de que los ciclos de producción sean mucho más largos que en la industria farmacéutica tradicional se explica por la necesidad de realizar un control de calidad del producto biológico:
La vacuna contra la Hæmophilus influenzæ tipo b es un buen ejemplo de ello:
Por ello, los procesos de fabricación presentan los niveles más exigentes y cumplen con las Buenas prácticas de fabricación en Europa así como las normas de la Administración de Fármacos y Alimentos de EE.UU. (FDA).
El control administrativo y los procedimientos de liberación también deben añadirse a la duración de la producción y al ciclo de liberación interno, ya que cada lote de vacuna producido y comercializado en Europa debe pasar por el Control de Laboratorio de las Autoridades Sanitarias Europeas pertinentes. Un certificado oficial de control debe expedirse antes de que la vacuna salga al mercado; procedimiento que generalmente dura dos meses.
Cualquier modificación en el proceso de fabricación también puede ser largo (hasta varios años para que se implemente). Se necesitan cinco años y una inversión de unos 15 millones de euros para que se apruebe la puesta en funcionamiento de una unidad de producción de antígeno nuevo.